Backup de la base de données :

mysqldump -h ip_hote_mysql -u utilisateur_mysql -p --default-character-set=latin1 --opt mabase > mabase_iso.sql

Conversion de caractères en supprimant les erreurs :

iconv -c -f utf-8 -t iso-8859-1 -o mabase_iso_correct.sql mabase_iso.sql

Puis import des données :

mysql -u utilisateur_mysql -p mabase < mabase_iso_correct.sql